- Научно-исследовательская часть (НИЧ)
- Научно-техническая библиотека (НТБ)
- Управление информатизации (УИ)
- Управление делами (УД)
- Учебно-методическое управление (УМУ)
- Планово-финансовое управление (ПФУ)
- Управление кадров (УК)
- Управление воспитательной работы (УВР)
- Управление по работе с филиалами (УРФ)
- Отдел международной деятельности (ОМД)
- Контрольно-ревизионный отдел (КРО)
- Юридическая служба (ЮС)
- Бухгалтерия
- Комбинат общественного питания (КОП)
- Опытно-экспериментальный завод
- Дворец культуры
- Спорткомплекс РГУПС
- Студенческий городок
- Редакционно-издательский центр (РИЦ)
- Отдел капитального строительства и ремонта (ОКСиР)
- Консультативно-диагностическая поликлиника
- Отдел материального обеспечения (ОМО)
- Дежурная служба (ДС)
- Отдел главного механика (ОГМ)
- Отдел главного энергетика (ОГЭ)
- Первый отдел
- Ремонтно-строительный отдел (РСО)
- Автоматическая телефонная станция (АТС)
- Отдел государственных закупок (ОГЗ)
- Гараж
- Производственно-эксплуатационное управление (ПЭУ)